More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1837 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
356 aa  715    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.58 
 
 
366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.46 
 
 
355 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.51 
 
 
342 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.09 
 
 
345 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.09 
 
 
345 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.67 
 
 
343 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.82 
 
 
346 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
369 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.62 
 
 
369 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
369 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
369 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
369 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.88 
 
 
369 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.78 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.22 
 
 
350 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.78 
 
 
350 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  42.11 
 
 
350 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  42.29 
 
 
350 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  42.11 
 
 
350 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.78 
 
 
353 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.1 
 
 
350 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.91 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  33.54 
 
 
368 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.36 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  42.67 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.11 
 
 
350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  34.01 
 
 
367 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  34.3 
 
 
367 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.83 
 
 
360 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.84 
 
 
347 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.29 
 
 
343 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.08 
 
 
364 aa  169  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  33.63 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.26 
 
 
350 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.7 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.09 
 
 
346 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.97 
 
 
350 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.12 
 
 
357 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  32.54 
 
 
376 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  35.76 
 
 
380 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.68 
 
 
349 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.13 
 
 
371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.64 
 
 
340 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.07 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.2 
 
 
368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.86 
 
 
345 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
372 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.01 
 
 
362 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.56 
 
 
369 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  33.43 
 
 
344 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.56 
 
 
369 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.01 
 
 
342 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.47 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.68 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.17 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.76 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.21 
 
 
367 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 
368 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  31.87 
 
 
371 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.99 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  34.09 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.05 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.34 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.02 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0851  hypothetical protein  32.68 
 
 
370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.584422  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.86 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.67 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.54 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.35 
 
 
336 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.8 
 
 
336 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.55 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  31.11 
 
 
377 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.55 
 
 
373 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.23 
 
 
373 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  30.48 
 
 
373 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.12 
 
 
378 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.09 
 
 
342 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32 
 
 
341 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.5 
 
 
377 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
382 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.29 
 
 
393 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30 
 
 
377 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.5 
 
 
377 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  29.92 
 
 
395 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 
356 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.15 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
341 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.15 
 
 
362 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.64 
 
 
385 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.09 
 
 
367 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  31.65 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  31.65 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>