More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0851 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0851  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  727    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.584422  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  43.87 
 
 
344 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.18 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.18 
 
 
350 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.55 
 
 
357 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.14 
 
 
350 aa  242  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.71 
 
 
350 aa  242  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.38 
 
 
345 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.83 
 
 
349 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.68 
 
 
346 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.64 
 
 
340 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.88 
 
 
341 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 
340 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  31.53 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.93 
 
 
336 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.73 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.25 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.68 
 
 
356 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.8 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.14 
 
 
342 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.47 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.42 
 
 
346 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1128  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.93 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391026  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.92 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.38 
 
 
327 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1177  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  34.48 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0928743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.74 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.4 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2483  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.94 
 
 
320 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.95 
 
 
321 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.02 
 
 
338 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.04 
 
 
326 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
345 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.64 
 
 
321 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3258  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.07 
 
 
355 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.915646  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
345 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3969  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.84 
 
 
321 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
341 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.98 
 
 
339 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.66 
 
 
350 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1769  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.14 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0415  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.14 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01302  L-Ala-D/L-Glu epimerase  32.17 
 
 
321 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
321 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01313  hypothetical protein  32.17 
 
 
321 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1440  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.17 
 
 
321 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.93 
 
 
367 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.84 
 
 
342 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.54 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.756048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.42 
 
 
327 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.82 
 
 
327 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1314  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.43 
 
 
336 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1971  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.85 
 
 
321 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28 
 
 
366 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.35 
 
 
350 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.35 
 
 
350 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.35 
 
 
350 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4609  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.44 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.34 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.53 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.671548  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.35 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.73 
 
 
350 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.04 
 
 
350 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2677  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.42 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.594823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1537  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.53 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1559  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.53 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.01 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1464  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.08 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.21548  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2300  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.53 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.467318  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4351  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.15 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.42 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.099364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.58 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.4 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  28.17 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2790  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.2 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.84 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4107  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.55 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.130678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.11 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.73 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.18 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.96 
 
 
332 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134382  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000679  muconate cycloisomerase  28.99 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.73 
 
 
353 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.3 
 
 
327 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1867  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  30.67 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.17899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.47 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2867  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.82 
 
 
326 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1805  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  30.67 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1651  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  30.67 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  hitchhiker  0.00630441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2150  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.5 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.16 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0100887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  29.79 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1904  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2387  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  28.83 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.991592  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  28.83 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1469  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  30.35 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.79096  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3415  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  0.341172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>