More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1938 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  740    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  95.1 
 
 
367 aa  698    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.29 
 
 
364 aa  262  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  42.61 
 
 
356 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  43.64 
 
 
350 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  43.94 
 
 
350 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  43.64 
 
 
350 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  43.94 
 
 
353 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  43.64 
 
 
350 aa  255  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  44.24 
 
 
353 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  43.33 
 
 
350 aa  255  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  43.33 
 
 
350 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  43.33 
 
 
350 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.12 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.48 
 
 
356 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.3 
 
 
347 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.64 
 
 
355 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.04 
 
 
346 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  37.82 
 
 
376 aa  216  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  40.06 
 
 
380 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.42 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.03 
 
 
366 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.17 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.45 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.45 
 
 
369 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.45 
 
 
369 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.45 
 
 
369 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.45 
 
 
369 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.17 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.06 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.17 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.17 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.17 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  36.41 
 
 
368 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.3 
 
 
356 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.79 
 
 
355 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.27 
 
 
342 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.63 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.61 
 
 
362 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  32.49 
 
 
356 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.68 
 
 
360 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  31.58 
 
 
370 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.62 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.76 
 
 
345 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.59 
 
 
356 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 
345 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 
345 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.81 
 
 
395 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 
372 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.97 
 
 
360 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 
343 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.65 
 
 
369 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  30.33 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.28 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.32 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.3 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  31.09 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.23 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  30.25 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  27.71 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.44 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.85 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.6 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.6 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.16 
 
 
409 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.2 
 
 
391 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
375 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.55 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.28 
 
 
367 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.69 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  28.41 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.23 
 
 
400 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.03 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.17 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  27.55 
 
 
377 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.14 
 
 
390 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  29.89 
 
 
377 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.89 
 
 
377 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  30 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
368 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  30 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.7 
 
 
375 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  29.7 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.48 
 
 
342 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  30 
 
 
377 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  29.7 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  29.7 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  29.7 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.75 
 
 
378 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.73 
 
 
345 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.43 
 
 
368 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.56 
 
 
370 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.61 
 
 
377 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.61 
 
 
377 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  28.66 
 
 
374 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  28.66 
 
 
372 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.75 
 
 
378 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.29 
 
 
373 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  29.39 
 
 
377 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>