More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4156 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 370 aa  756    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  79.56 
 
 		 367 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  79.56 
 
 		 367 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  79.56 
 
 		 367 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  77.66 
 
 		 367 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  72.21 
 
 		 367 aa  551  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  71.66 
 
 		 367 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.55 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.89 
 
 		 362 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.27 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.57 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.03 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.03 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.03 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.51 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.11 
 
 		 369 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.03 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.03 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  31.7 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 		 374 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  31.18 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.43 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  31.17 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.15 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.27 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.37 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.69 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.33 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  29.21 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.33 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  29.27 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  29.14 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.15 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.19 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.6 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.87 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.48 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  28.11 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.95 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.17 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.17 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.65 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.17 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.86 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  27.25 
 
 		 400 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.86 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.54 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.79 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.76 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.22 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  26.56 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.73 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  27.91 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.79 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  26.25 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28.46 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.6 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.6 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  30.38 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.14 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.82 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.79 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.02 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.16 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  29 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.48 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2539  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.3 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.25 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.16 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.16 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.74 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  27.1 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.94 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  27.37 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.38 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.15 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.89 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.89 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.63 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.34 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.9 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  27.64 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.13 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>