More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1174 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  100 
 
 		 396 aa  789    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  75.27 
 
 		 378 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  71.98 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.59 
 
 		 378 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  74.59 
 
 		 378 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  71.58 
 
 		 396 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  66.4 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.76 
 
 		 391 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  61.41 
 
 		 374 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  60.65 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  61.5 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.22 
 
 		 369 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  66.57 
 
 		 377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  61.04 
 
 		 374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.49 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  64.4 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  65.12 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  65.12 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  65.12 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  64.67 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  64.85 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  64.85 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  64.85 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  64.85 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  63.32 
 
 		 385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  60.16 
 
 		 373 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  64.67 
 
 		 377 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.19 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  62.23 
 
 		 373 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.19 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.51 
 
 		 373 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.78 
 
 		 373 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  62.5 
 
 		 385 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.24 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  65.19 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.24 
 
 		 375 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  65.19 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  59.19 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  59.24 
 
 		 373 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  62.5 
 
 		 385 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  62.23 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  53.99 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  51.5 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  47.7 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  47.17 
 
 		 395 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  47.43 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  44.72 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.07 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  44.72 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  44.96 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  43.77 
 
 		 389 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  40.33 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  43.77 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.61 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.61 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.34 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.87 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.78 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.78 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.34 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.07 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.34 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.78 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.2 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.79 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.52 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.79 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.37 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.79 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.25 
 
 		 367 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.43 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.36 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  30.48 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.61 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.22 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.27 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  29.5 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  28.86 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.35 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.93 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.05 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  28.65 
 
 		 367 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.42 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  28.78 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.8 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.84 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.71 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.61 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.31 
 
 		 350 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.93 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.81 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.61 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.5 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  26.1 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.93 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.93 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>