More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5793 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
390 aa  798    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.13 
 
 
369 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.13 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.13 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.87 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.87 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.13 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.87 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.87 
 
 
369 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.87 
 
 
369 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.87 
 
 
369 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.15 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.82 
 
 
372 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  32.66 
 
 
391 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  29.66 
 
 
374 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  30.29 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  29.92 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.63 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.82 
 
 
375 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  28.65 
 
 
400 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.52 
 
 
378 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.57 
 
 
378 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  28.9 
 
 
395 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.27 
 
 
387 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  31.43 
 
 
377 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.27 
 
 
378 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.97 
 
 
366 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.02 
 
 
391 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  32.32 
 
 
356 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  31.94 
 
 
373 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  31.94 
 
 
373 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4007  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.1 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.17 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.21 
 
 
369 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.91 
 
 
373 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.93 
 
 
367 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.21 
 
 
369 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.91 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  29.06 
 
 
373 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.27 
 
 
367 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 
367 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.8 
 
 
364 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.11 
 
 
374 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.39 
 
 
373 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.2 
 
 
396 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.93 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.18 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.89 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.61 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.65 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.21 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  25.67 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  26.79 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.2 
 
 
367 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.76 
 
 
390 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.8 
 
 
386 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.99 
 
 
367 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.33 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  26.82 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.08 
 
 
377 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.31 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.95 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.11 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.08 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.56 
 
 
393 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.04 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.41 
 
 
350 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.41 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.87 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.08 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.73 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2848  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.02 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.7 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.15 
 
 
387 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1187  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.21 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.46 
 
 
370 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  26.32 
 
 
370 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.41 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.41 
 
 
350 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.41 
 
 
350 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  26.3 
 
 
377 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 
353 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.93 
 
 
372 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.1 
 
 
350 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.98 
 
 
388 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  27.08 
 
 
385 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.6 
 
 
377 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.6 
 
 
377 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  27.53 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.93 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.65 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  26.42 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  26.42 
 
 
377 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.8 
 
 
346 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  26.42 
 
 
377 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.24 
 
 
377 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  26.17 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  26.42 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>