More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2645 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
369 aa  752    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.84 
 
 
370 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.95 
 
 
370 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  46.34 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  49.31 
 
 
369 aa  354  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.86 
 
 
368 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.62 
 
 
371 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.72 
 
 
368 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.79 
 
 
375 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.31 
 
 
370 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  50.14 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.94 
 
 
370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.53 
 
 
368 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  47.43 
 
 
370 aa  332  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.38 
 
 
380 aa  332  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.54 
 
 
370 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.63 
 
 
370 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  53.12 
 
 
366 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.34 
 
 
371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  52.27 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  45.03 
 
 
368 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  45.03 
 
 
368 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  45.03 
 
 
368 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  45.03 
 
 
368 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  44.75 
 
 
368 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  45.03 
 
 
368 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  44.75 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  44.48 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  44.75 
 
 
368 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.57 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.51 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.41 
 
 
369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  51.42 
 
 
370 aa  305  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.43 
 
 
377 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  50 
 
 
369 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.06 
 
 
372 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.31 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.11 
 
 
377 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  39.26 
 
 
376 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.42 
 
 
378 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.38 
 
 
391 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.29 
 
 
351 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  30.11 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.97 
 
 
385 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 
955 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  32.52 
 
 
366 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  34.9 
 
 
331 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  34.64 
 
 
334 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.89 
 
 
386 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.11 
 
 
367 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.27 
 
 
377 aa  143  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  27.05 
 
 
1027 aa  143  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.06 
 
 
367 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.65 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.7 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.22 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  28.17 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  28.17 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  32.04 
 
 
391 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  29.56 
 
 
400 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 
369 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 
369 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 
369 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.37 
 
 
364 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.2 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.96 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.88 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.93 
 
 
369 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.93 
 
 
369 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 
370 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.2 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.67 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.67 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  29.29 
 
 
356 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.67 
 
 
369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.81 
 
 
369 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.81 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.59 
 
 
396 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  27.47 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.75 
 
 
350 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.75 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.7 
 
 
365 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.92 
 
 
350 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.02 
 
 
390 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  36.92 
 
 
359 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  29.38 
 
 
368 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.8 
 
 
366 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.96 
 
 
380 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.53 
 
 
350 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.52 
 
 
390 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.96 
 
 
394 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.08 
 
 
360 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.83 
 
 
350 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.83 
 
 
350 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.83 
 
 
353 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.17 
 
 
372 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.84 
 
 
378 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>