More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3321 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 372 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1488  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.82 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.76 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000368984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.64 
 
 		 435 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18905  decreased coverage  0.00252858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2699  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.01 
 
 		 421 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.88946  normal  0.681606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.55 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0479  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.79 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.663029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.52 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4200  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.06 
 
 		 421 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2911  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.46 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1029  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.9 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1955  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.72 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1083  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.67 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00426043  hitchhiker  0.00242262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6284  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.78 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0645  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.05 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2716  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734376  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.77 
 
 		 395 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3003  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000677382 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5845  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.46 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3283  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.11 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0754  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 		 421 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.14 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00613  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672902  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.44 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.07 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.8 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0254  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.92 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.346472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.03 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0941  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748604  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.76 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.96 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.76 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1996  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 		 435 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1796  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036992  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.53 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.22 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.26 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.84 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  30.75 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.1 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0842  Glucarate dehydratase  26.94 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.46 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.27 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  28.32 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.21 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  25.71 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.46 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1017  glucarate dehydratase  28.94 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0552689  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  29.44 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.47 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  27.46 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  28.35 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  25.42 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  29.29 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  25.14 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  27.75 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.42 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  28.53 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.11 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2654  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.49 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  26.06 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3241  D-glucarate dehydratase  31.65 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  28.61 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  26.06 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  26.06 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  24.78 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  28.61 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  25.78 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  25.78 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  25.78 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0808  Glucarate dehydratase  31 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.8 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3721  D-glucarate dehydratase  30.87 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  25.78 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.12 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.57 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1155  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  25.5 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  25.21 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.4 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.53 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  25.21 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.09 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  25.21 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3183  glucarate dehydratase  31.58 
 
 		 446 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.558486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3120  glucarate dehydratase  32.78 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3102  glucarate dehydratase  31.58 
 
 		 446 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3167  glucarate dehydratase  31.58 
 
 		 446 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.153553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.86 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  25.21 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  25.21 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.08 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02633  predicted glucarate dehydratase  31.9 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3092  glucarate dehydratase  31.14 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.026036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>