More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0823 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
372 aa  766    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.44 
 
 
375 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.39 
 
 
370 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.06 
 
 
369 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.9 
 
 
371 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.67 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  39.39 
 
 
368 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  40.99 
 
 
368 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  38.95 
 
 
368 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  38.95 
 
 
368 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  38.95 
 
 
368 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  38.67 
 
 
368 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  38.67 
 
 
368 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  36.91 
 
 
369 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  40.7 
 
 
368 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.85 
 
 
368 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  39.51 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.67 
 
 
368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  40.41 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.81 
 
 
370 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  39.09 
 
 
370 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.29 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.29 
 
 
370 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.01 
 
 
370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.02 
 
 
370 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  43.01 
 
 
366 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  43.01 
 
 
366 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.94 
 
 
368 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  37.25 
 
 
369 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.12 
 
 
368 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.4 
 
 
371 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  40.55 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.46 
 
 
377 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  38.8 
 
 
370 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.11 
 
 
370 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.42 
 
 
380 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.29 
 
 
369 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.7 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  35.47 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
378 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  30.16 
 
 
370 aa  179  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 
391 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.96 
 
 
385 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 
955 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
351 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  29.41 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.03 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  31.8 
 
 
1027 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  27.73 
 
 
370 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.82 
 
 
356 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.71 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.98 
 
 
331 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.86 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.07 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.39 
 
 
369 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.85 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.12 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.59 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.85 
 
 
369 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.71 
 
 
386 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  28.46 
 
 
374 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.12 
 
 
369 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.12 
 
 
369 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.68 
 
 
355 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.96 
 
 
390 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.87 
 
 
386 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.85 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.58 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  28.61 
 
 
391 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.83 
 
 
356 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  28.26 
 
 
372 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.22 
 
 
385 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  28.49 
 
 
374 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.99 
 
 
364 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.15 
 
 
382 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  24.45 
 
 
368 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  28.57 
 
 
356 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 
366 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.15 
 
 
395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.49 
 
 
387 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  25.47 
 
 
400 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.97 
 
 
346 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.73 
 
 
353 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.69 
 
 
367 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.3 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.11 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.4 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.3 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.33 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.99 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  25.15 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.61 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.39 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.62 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.47 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.02 
 
 
353 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  24.66 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.99 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.99 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>