More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3234 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
370 aa  769    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  80 
 
 
370 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  79.73 
 
 
370 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.37 
 
 
371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.3 
 
 
375 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50 
 
 
370 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.46 
 
 
368 aa  345  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  47.61 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  48.96 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  48.7 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  48.96 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  44.44 
 
 
369 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  48.37 
 
 
368 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  46.48 
 
 
368 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  48.37 
 
 
368 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  47.04 
 
 
368 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.63 
 
 
369 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  45.92 
 
 
368 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.37 
 
 
368 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  42.86 
 
 
370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  44.32 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.26 
 
 
370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.13 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  43.05 
 
 
372 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.84 
 
 
368 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  45.13 
 
 
366 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  44.82 
 
 
366 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.38 
 
 
369 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.51 
 
 
377 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.9 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.46 
 
 
370 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.01 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.12 
 
 
380 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.72 
 
 
370 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.36 
 
 
377 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  40.05 
 
 
370 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  42.74 
 
 
369 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.53 
 
 
391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.25 
 
 
378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  30.34 
 
 
376 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  29.78 
 
 
370 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
955 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.43 
 
 
385 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.7 
 
 
377 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  27.32 
 
 
366 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.32 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  29.89 
 
 
1027 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.43 
 
 
386 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 
355 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.34 
 
 
356 aa  116  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.31 
 
 
331 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
367 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.99 
 
 
395 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.18 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.3 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  26.02 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  26.87 
 
 
368 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  25.68 
 
 
367 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.53 
 
 
350 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.22 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.65 
 
 
346 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.24 
 
 
350 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  25.68 
 
 
367 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.24 
 
 
350 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
366 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.94 
 
 
353 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.24 
 
 
350 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.68 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.9 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.82 
 
 
369 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.65 
 
 
369 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.15 
 
 
350 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.9 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.9 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.98 
 
 
334 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.72 
 
 
369 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.94 
 
 
350 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.72 
 
 
369 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.94 
 
 
350 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 
370 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.64 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.18 
 
 
369 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.69 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.18 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.28 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.4 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  24.87 
 
 
409 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.28 
 
 
369 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.67 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.25 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  26.29 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.97 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.42 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 
375 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.39 
 
 
367 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.1 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.04 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>