More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0655 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
377 aa  729    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.45 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.29 
 
 
375 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.79 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  32.1 
 
 
368 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  32.1 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  32.1 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  31.82 
 
 
368 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  33.76 
 
 
368 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  33.44 
 
 
368 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.47 
 
 
368 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  33.12 
 
 
368 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  32.48 
 
 
368 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  33.77 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  34.19 
 
 
368 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  38.05 
 
 
366 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  33.93 
 
 
372 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  37.97 
 
 
369 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  37.28 
 
 
366 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.73 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.68 
 
 
370 aa  162  7e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.66 
 
 
370 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.9 
 
 
370 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.59 
 
 
368 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.78 
 
 
370 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.09 
 
 
370 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
370 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  35.14 
 
 
370 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.27 
 
 
369 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.03 
 
 
372 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  38.07 
 
 
369 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.7 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.2 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.78 
 
 
377 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.52 
 
 
368 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 
391 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
955 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.99 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.24 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  28.05 
 
 
370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.52 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  26.02 
 
 
1027 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 
378 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.96 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.97 
 
 
362 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.62 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.42 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.96 
 
 
369 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.96 
 
 
369 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  29.06 
 
 
376 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.62 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.31 
 
 
369 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.94 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  27.13 
 
 
366 aa  99.8  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.28 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.15 
 
 
369 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.94 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.24 
 
 
385 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.1 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.46 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.63 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.47 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.23 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.32 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.18 
 
 
382 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.85 
 
 
350 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.51 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.35 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.4 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.32 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.33 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.41 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  24.83 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.39 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.74 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.15 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.34 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.25 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.91 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.9 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.51 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  27.43 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.02 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.25 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.57 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  26.82 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.87 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.03 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.13 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.6 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.6 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  29.74 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.13 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.24 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>