More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04247 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  100 
 
 
356 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  74.01 
 
 
364 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.59 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  47.63 
 
 
353 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  46.75 
 
 
353 aa  292  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  46.45 
 
 
350 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  46.45 
 
 
350 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  46.15 
 
 
350 aa  288  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  48.46 
 
 
350 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  45.56 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  45.56 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  45.56 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.45 
 
 
350 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  42.61 
 
 
367 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  42.9 
 
 
367 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.91 
 
 
347 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  43.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.71 
 
 
355 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.12 
 
 
367 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  39.45 
 
 
376 aa  220  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.52 
 
 
369 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.85 
 
 
369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.07 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.05 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.52 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.52 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.99 
 
 
369 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.24 
 
 
369 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.1 
 
 
346 aa  208  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.81 
 
 
342 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.19 
 
 
343 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.42 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.08 
 
 
360 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  33.82 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  35.57 
 
 
356 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.46 
 
 
345 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.68 
 
 
365 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.63 
 
 
356 aa  176  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.46 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.78 
 
 
343 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.13 
 
 
346 aa  165  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.32 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.75 
 
 
372 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.12 
 
 
345 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.47 
 
 
390 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 
368 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.32 
 
 
355 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.8 
 
 
368 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.46 
 
 
349 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  32.77 
 
 
377 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  28.37 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  29.97 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  33.62 
 
 
377 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  33.62 
 
 
377 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  33.62 
 
 
377 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  33.62 
 
 
377 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.44 
 
 
369 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  33.62 
 
 
377 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  33.62 
 
 
377 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.43 
 
 
396 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.77 
 
 
377 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.09 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  31.37 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.66 
 
 
372 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  29.91 
 
 
370 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  34.7 
 
 
391 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.32 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.62 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.2 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 
378 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.57 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.53 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.92 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.36 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.45 
 
 
360 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0941  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 
389 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748604  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.64 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.64 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.36 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
386 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  30.51 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.07 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.29 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.48 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.29 
 
 
378 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.68 
 
 
377 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.79 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.86 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.62 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  31.92 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  32.01 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  30 
 
 
373 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.21 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.39 
 
 
377 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>