More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0097 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
345 aa  715    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  41.72 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.1 
 
 
345 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.39 
 
 
349 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.58 
 
 
342 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.82 
 
 
340 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.1 
 
 
350 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.1 
 
 
350 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.1 
 
 
350 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.54 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.09 
 
 
357 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 
340 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.75 
 
 
336 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.05 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.65 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.78 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.51 
 
 
336 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  30.79 
 
 
344 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.63 
 
 
342 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.34 
 
 
339 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.04 
 
 
345 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 
355 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1670  L-alanine-DL-glutamate epimerase  37.38 
 
 
344 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.47 
 
 
356 aa  142  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.39 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.14 
 
 
369 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.14 
 
 
369 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
369 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.14 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
369 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 
369 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.67 
 
 
331 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 
327 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.36 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.99 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.13 
 
 
327 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.25 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134382  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1128  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391026  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.1 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.48 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.25 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.23 
 
 
356 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.36 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.099364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  31.73 
 
 
367 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4541  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.45 
 
 
326 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2677  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.78 
 
 
326 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.594823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.68 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4609  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  32.02 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1559  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.89 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0851  hypothetical protein  27.47 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.584422  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2300  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.89 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.467318  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01302  L-Ala-D/L-Glu epimerase  31.89 
 
 
321 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.89 
 
 
321 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.06 
 
 
321 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.23 
 
 
321 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.671548  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01313  hypothetical protein  31.89 
 
 
321 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1440  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.89 
 
 
321 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1971  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.89 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.06 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5558  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.13 
 
 
331 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
353 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2387  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.72 
 
 
324 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.991592  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1904  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.72 
 
 
324 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.72 
 
 
324 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.56 
 
 
364 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.95 
 
 
326 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.15 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1537  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.89 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.84 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1314  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.48 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
350 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  28.24 
 
 
328 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3969  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.1 
 
 
321 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.68 
 
 
354 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.84 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.84 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.15 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1177  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  30.47 
 
 
450 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0928743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3258  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.48 
 
 
355 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.915646  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2483  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.35 
 
 
320 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.79 
 
 
338 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4351  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.65 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2150  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.35 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1626  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.23 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.584228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  29.31 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.84 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1018  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.12 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0365  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.07 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.13 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2790  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.38 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.17 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.43 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2196  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.9 
 
 
327 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.965659  normal  0.067704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>