More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2780 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  100 
 
 
339 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  38.91 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.94 
 
 
345 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.17 
 
 
342 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.37 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.74 
 
 
341 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.67 
 
 
342 aa  195  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.71 
 
 
340 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.84 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.33 
 
 
336 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
336 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.24 
 
 
346 aa  185  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.24 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.14 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.84 
 
 
338 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.24 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.1 
 
 
350 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.59 
 
 
350 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.85 
 
 
336 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.59 
 
 
350 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1314  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.05 
 
 
336 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.48 
 
 
321 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
345 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.77 
 
 
326 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.05 
 
 
332 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134382  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  32.95 
 
 
344 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.09 
 
 
327 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.65 
 
 
326 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.099364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3415  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.18 
 
 
326 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.02 
 
 
341 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2677  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.34 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.594823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2556  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.58 
 
 
333 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.42 
 
 
354 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2483  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.54 
 
 
320 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0365  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.79 
 
 
317 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.42 
 
 
327 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256273  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1085  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.61 
 
 
333 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11488  normal  0.296845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1177  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  38.82 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0928743  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.47 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.02 
 
 
327 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2867  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.14 
 
 
326 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1018  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.48 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0985  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.48 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.07 
 
 
327 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.46 
 
 
327 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0415  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.15 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1769  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.15 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
326 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4609  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.28 
 
 
331 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.37 
 
 
357 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.5 
 
 
326 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.756048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2968  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.47 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.708756  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1976  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  39.05 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.49704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.94 
 
 
321 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1451  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.56 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.470419  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.86 
 
 
342 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.2 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.62 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  32.87 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1626  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.94 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.584228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1041  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  37.81 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00062524  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2196  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.51 
 
 
327 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.965659  normal  0.067704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1128  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.19 
 
 
344 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391026  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.31 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.78 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1670  L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.15 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.4 
 
 
350 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.4 
 
 
350 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4541  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.34 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.58 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.94 
 
 
353 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  33.73 
 
 
367 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.13 
 
 
343 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.39 
 
 
350 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.92 
 
 
326 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2790  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.19 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.78 
 
 
350 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.4 
 
 
350 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5558  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  36.31 
 
 
331 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.26 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.02 
 
 
367 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1635  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.86 
 
 
331 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1464  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.33 
 
 
335 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.21548  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3258  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 
355 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.915646  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.29 
 
 
356 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.18 
 
 
364 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.32 
 
 
353 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01302  L-Ala-D/L-Glu epimerase  35.56 
 
 
321 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.56 
 
 
321 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1440  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.56 
 
 
321 aa  122  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01313  hypothetical protein  35.56 
 
 
321 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  33.62 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1971  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.95 
 
 
321 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1806  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  34.95 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384509  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.35 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1559  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.65 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2300  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.65 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.467318  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.74 
 
 
347 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.46 
 
 
321 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.671548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>