More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0055 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
343 aa  687    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.18 
 
 
343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.41 
 
 
342 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.16 
 
 
345 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.86 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.28 
 
 
356 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.34 
 
 
346 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.85 
 
 
360 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.34 
 
 
350 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.34 
 
 
350 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.34 
 
 
350 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.04 
 
 
350 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.87 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.74 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.74 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.04 
 
 
350 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.63 
 
 
356 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.71 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.25 
 
 
355 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.67 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.89 
 
 
362 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.46 
 
 
366 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.31 
 
 
353 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.64 
 
 
347 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.83 
 
 
350 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.29 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  32.45 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  32.75 
 
 
356 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
341 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.42 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.35 
 
 
367 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.65 
 
 
369 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.67 
 
 
364 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.65 
 
 
369 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.2 
 
 
369 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.88 
 
 
369 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.54 
 
 
369 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.65 
 
 
369 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.54 
 
 
369 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.31 
 
 
369 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.2 
 
 
369 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.2 
 
 
369 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  30.03 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  30.03 
 
 
367 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.84 
 
 
368 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.52 
 
 
368 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
368 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.82 
 
 
346 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.21 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.55 
 
 
355 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.23 
 
 
367 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  33.04 
 
 
356 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
365 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  29.09 
 
 
380 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 
349 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  32.8 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.13 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  30.12 
 
 
362 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.94 
 
 
342 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.45 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.15 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.53 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.73 
 
 
350 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.02 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.65 
 
 
341 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 
350 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.32 
 
 
336 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.83 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  25.93 
 
 
370 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.86 
 
 
340 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.36 
 
 
367 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.47 
 
 
395 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  30.09 
 
 
344 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.4 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  23.27 
 
 
362 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.53 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.91 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.16 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.91 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.63 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  27.99 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.04 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.48 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  27.03 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.3 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.38 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.06 
 
 
321 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  25.52 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.3 
 
 
378 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 
377 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0851  hypothetical protein  25.5 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.584422  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  26.07 
 
 
400 aa  94  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.06 
 
 
327 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  23.66 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1537  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.3 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.79 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  26.54 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>