More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2963 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  86.02 
 
 
373 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  85.48 
 
 
373 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  90.32 
 
 
377 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  100 
 
 
373 aa  755    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  86.02 
 
 
373 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  87.37 
 
 
373 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  74.46 
 
 
373 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  75 
 
 
373 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  65.12 
 
 
374 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  64.85 
 
 
374 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  64.67 
 
 
372 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  62.7 
 
 
375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.78 
 
 
377 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  60.33 
 
 
369 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  60.05 
 
 
369 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  59.13 
 
 
377 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  58.86 
 
 
377 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  62.77 
 
 
387 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  58.58 
 
 
377 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  58.27 
 
 
377 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  57.49 
 
 
396 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  58.31 
 
 
377 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  57.99 
 
 
377 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  58.31 
 
 
377 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  58.31 
 
 
377 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.45 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  55.38 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  56.18 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  56.18 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  59.08 
 
 
391 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  56.6 
 
 
385 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  56.87 
 
 
385 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  54.22 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2108  muconate cycloisomerase  55.8 
 
 
385 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  54.35 
 
 
390 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  59.24 
 
 
396 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  50.27 
 
 
372 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  48.12 
 
 
395 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  48.65 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  48.65 
 
 
400 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  46.97 
 
 
394 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.11 
 
 
409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  40.49 
 
 
370 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2373  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.34 
 
 
389 aa  289  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.385749  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  41.96 
 
 
370 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1329  muconate and chloromuconate cycloisomerase  46.34 
 
 
389 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  41.03 
 
 
400 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.96 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.58 
 
 
369 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.53 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.3 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.06 
 
 
390 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 
367 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.73 
 
 
369 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 
356 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.89 
 
 
367 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.46 
 
 
367 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.57 
 
 
386 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 
367 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 
367 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.31 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.19 
 
 
367 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  32.06 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  29.95 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.72 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  30.51 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.11 
 
 
370 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  26.8 
 
 
367 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  29.17 
 
 
368 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
356 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  28.24 
 
 
376 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.66 
 
 
367 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 
346 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  26.22 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.72 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.8 
 
 
381 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3433  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 
381 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.37 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.96 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.25 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.29 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.74 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.73 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.23 
 
 
360 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.78 
 
 
370 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 
347 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>