More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5487 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
372 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.59 
 
 
362 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.46 
 
 
356 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.67 
 
 
371 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.5 
 
 
368 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.66 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.4 
 
 
368 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 
342 aa  200  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.31 
 
 
360 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.38 
 
 
368 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.87 
 
 
343 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.38 
 
 
367 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.05 
 
 
345 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.73 
 
 
356 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.05 
 
 
345 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.23 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.92 
 
 
350 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.74 
 
 
350 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.44 
 
 
350 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.13 
 
 
350 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.13 
 
 
350 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.74 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.13 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  35.85 
 
 
380 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.52 
 
 
353 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  32.16 
 
 
356 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.89 
 
 
353 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.79 
 
 
355 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.44 
 
 
346 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.38 
 
 
367 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.23 
 
 
347 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
356 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  29.3 
 
 
367 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.83 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.42 
 
 
368 aa  153  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.86 
 
 
365 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.71 
 
 
376 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.4 
 
 
341 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.56 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.73 
 
 
367 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  34.59 
 
 
356 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.49 
 
 
346 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.14 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.33 
 
 
395 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.98 
 
 
369 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.7 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.7 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.7 
 
 
369 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.14 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  32.76 
 
 
373 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.86 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.69 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.42 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.42 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.36 
 
 
342 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.61 
 
 
339 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.61 
 
 
409 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.42 
 
 
326 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.27 
 
 
357 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2556  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.6 
 
 
333 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.52 
 
 
336 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.67 
 
 
336 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.15 
 
 
350 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.04 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.67 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  28.65 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.96 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.73 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  39.42 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.04 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.25 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.5 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134382  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.94 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  29.34 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.96 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.81 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.16 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.96 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.37 
 
 
349 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.08 
 
 
373 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  30.36 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.69 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.69 
 
 
326 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.099364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.07 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2677  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.69 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.594823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.94 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.43 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.92 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.49 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.29 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  33.7 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  35.71 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.77 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>