More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2982 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
371 aa  730    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  86.58 
 
 
368 aa  585  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.81 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.49 
 
 
356 aa  332  8e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.67 
 
 
372 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.65 
 
 
342 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.58 
 
 
343 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.94 
 
 
360 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.24 
 
 
345 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.24 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.25 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2417  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.74 
 
 
368 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.22 
 
 
366 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.67 
 
 
343 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.63 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.91 
 
 
350 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.92 
 
 
350 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.04 
 
 
350 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.04 
 
 
350 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.04 
 
 
350 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.04 
 
 
350 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.75 
 
 
350 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.04 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.2 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.86 
 
 
356 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.63 
 
 
367 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 
346 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.92 
 
 
355 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.13 
 
 
356 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.45 
 
 
368 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.53 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  36.42 
 
 
380 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.04 
 
 
346 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  29.91 
 
 
376 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  33.62 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  31.1 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.85 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  31.3 
 
 
367 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.06 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.18 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.86 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2387  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  32.12 
 
 
324 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.991592  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1904  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.12 
 
 
324 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  32.12 
 
 
324 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.52 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.82 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.16 
 
 
367 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.9 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.58 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.65 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.88 
 
 
341 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 
350 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.43 
 
 
350 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.13 
 
 
350 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.95 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.78 
 
 
327 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 
338 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.64 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2867  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.86 
 
 
326 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.24 
 
 
395 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  32.85 
 
 
356 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2483  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.1 
 
 
320 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.36 
 
 
357 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.07 
 
 
393 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.66 
 
 
354 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.82 
 
 
321 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.47 
 
 
326 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.756048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 
326 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1464  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35 
 
 
335 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.21548  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1018  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.88 
 
 
326 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1314  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.72 
 
 
336 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.75 
 
 
350 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  31.03 
 
 
344 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0985  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.88 
 
 
326 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.36 
 
 
377 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.29 
 
 
400 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.29 
 
 
400 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.79 
 
 
326 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3969  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.12 
 
 
321 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.81 
 
 
377 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.41 
 
 
331 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.54 
 
 
321 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.671548  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.64 
 
 
369 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.1 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.95 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.09 
 
 
373 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.95 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1651  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  32.25 
 
 
321 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  hitchhiker  0.00630441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.69 
 
 
332 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134382  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4351  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.15 
 
 
349 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.34 
 
 
375 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.58 
 
 
369 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1805  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  32.25 
 
 
321 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0851  hypothetical protein  33.58 
 
 
370 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.584422  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.32 
 
 
358 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2196  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.36 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.965659  normal  0.067704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1469  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  31.95 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.79096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
367 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>