More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1469 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1867  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  99.07 
 
 
321 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.17899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1806  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  99.38 
 
 
321 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384509  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1469  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  100 
 
 
321 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.79096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1805  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  99.69 
 
 
321 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1651  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  99.38 
 
 
321 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  hitchhiker  0.00630441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1537  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  86.29 
 
 
321 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01302  L-Ala-D/L-Glu epimerase  85.67 
 
 
321 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  85.67 
 
 
321 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  85.36 
 
 
321 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.671548  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01313  hypothetical protein  85.67 
 
 
321 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1559  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  85.36 
 
 
321 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1440  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  85.67 
 
 
321 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2300  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  85.36 
 
 
321 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.467318  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1971  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  85.05 
 
 
321 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2150  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  78.5 
 
 
321 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  70.4 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  67.91 
 
 
324 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1904  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  67.91 
 
 
324 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2387  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  67.91 
 
 
324 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.991592  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  50.75 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.91 
 
 
321 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000679  muconate cycloisomerase  48.17 
 
 
330 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.71 
 
 
326 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.756048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2867  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.81 
 
 
326 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1985  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.65 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503253  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3969  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.04 
 
 
321 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.02 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.94 
 
 
326 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.66 
 
 
322 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0100887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  44.73 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2509  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.34 
 
 
341 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0306929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2483  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.21 
 
 
320 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.22 
 
 
327 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256273  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.59 
 
 
327 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1177  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  47.12 
 
 
450 aa  258  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0928743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.77 
 
 
326 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4107  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.04 
 
 
322 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.130678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2196  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.01 
 
 
327 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.965659  normal  0.067704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.89 
 
 
338 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1018  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  44.09 
 
 
326 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0985  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  44.09 
 
 
326 aa  255  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1314  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  45.19 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3415  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.67 
 
 
326 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.17 
 
 
336 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.47 
 
 
331 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2790  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  46.42 
 
 
341 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4541  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.19 
 
 
326 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.81 
 
 
326 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1041  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  46.56 
 
 
329 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00062524  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1451  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  48.08 
 
 
331 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.470419  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1769  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47 
 
 
320 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0415  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47 
 
 
320 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2808  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.03 
 
 
334 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2556  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45 
 
 
333 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.69 
 
 
326 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.099364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2677  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.69 
 
 
326 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.594823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1085  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  45.51 
 
 
333 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11488  normal  0.296845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1635  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  44.87 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3258  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.915646  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2968  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  44.41 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.708756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4112  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.16 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5558  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  46.38 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  44.03 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.34 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134382  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1626  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.39 
 
 
331 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.584228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0365  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  42.59 
 
 
317 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1268  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.17 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0161806  hitchhiker  0.00728152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4351  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.69 
 
 
349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1976  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  43.03 
 
 
329 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.49704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1128  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.8 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391026  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1464  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.74 
 
 
335 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.21548  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.76 
 
 
354 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.31 
 
 
345 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.73 
 
 
349 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.57 
 
 
346 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4609  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.16 
 
 
331 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.6 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
350 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.23 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.54 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.15 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.98 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.88 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.37 
 
 
350 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  33.44 
 
 
371 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.92 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.64 
 
 
350 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  34.2 
 
 
344 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.47 
 
 
366 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.44 
 
 
345 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.85 
 
 
350 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2780  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.46 
 
 
339 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.43 
 
 
350 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
336 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6424  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.33 
 
 
336 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.92 
 
 
347 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.94 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.33 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.93 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0097  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.6 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>