More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6270 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
367 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2539  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.94 
 
 
367 aa  276  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2920  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.14 
 
 
371 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688368  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1187  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.88 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4007  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.6 
 
 
368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2848  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.69 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.05 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.52 
 
 
355 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.44 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.24 
 
 
369 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.18 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.93 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.24 
 
 
369 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.24 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.18 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.18 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.18 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.12 
 
 
369 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.61 
 
 
350 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.61 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.45 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
365 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3433  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 
381 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428257  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.61 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.2 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  27.05 
 
 
368 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  27.05 
 
 
368 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.84 
 
 
364 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.78 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  27.74 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.61 
 
 
350 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  27.4 
 
 
368 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  27.4 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  28.08 
 
 
368 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  27.05 
 
 
368 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  27.4 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  27.05 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.19 
 
 
370 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  26.39 
 
 
356 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.6 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.55 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.38 
 
 
368 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  27.73 
 
 
367 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.64 
 
 
378 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  28.02 
 
 
369 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 
350 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  25.58 
 
 
391 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  27.1 
 
 
367 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.71 
 
 
368 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.57 
 
 
370 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.89 
 
 
347 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.98 
 
 
367 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
367 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.84 
 
 
356 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
367 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.15 
 
 
350 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.96 
 
 
367 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  27.82 
 
 
368 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.68 
 
 
406 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.31 
 
 
391 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.56 
 
 
370 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.76 
 
 
369 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.82 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.02 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  26.02 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.93 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.78 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.71 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.74 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.83 
 
 
377 aa  95.9  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.01 
 
 
350 aa  95.9  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.41 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.95 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.65 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.4 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.5 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.18 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.45 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.41 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.18 
 
 
342 aa  93.6  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.68 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.87 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.65 
 
 
403 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  26.51 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.67 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.92 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.61 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  26.47 
 
 
372 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.78 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  26.99 
 
 
382 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>