123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004029 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 		 329 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  88.15 
 
 		 329 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  67.07 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  60.61 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  55.49 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  54.88 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  57.73 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  54.43 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  54.43 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  54.43 
 
 		 323 aa  352  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  57.41 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  57.41 
 
 		 320 aa  352  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  57.1 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.1 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  57.1 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  57.1 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  57.1 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  57.1 
 
 		 320 aa  348  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  56.15 
 
 		 320 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  55.42 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  54.8 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  56.15 
 
 		 320 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  54.13 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  52.13 
 
 		 322 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  54.8 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  51.99 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  55.84 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  51.52 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  32.26 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  33.93 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  30.88 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  32.93 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  33.13 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  30.61 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  34.6 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  34.31 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.06 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  33.72 
 
 		 366 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  32.58 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  32.84 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  33.73 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  30.54 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  29.54 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  31.12 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.66 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.48 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.56 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.98 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.89 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.12 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.62 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.88 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.63 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  23.48 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.85 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.94 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  28.74 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.1 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.72 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.7 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.89 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.79 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.87 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  22.96 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.05 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  28.92 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  27.72 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.2 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  26.13 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.32 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  27.42 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.05 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  26.01 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.44 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.86 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  26.01 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.05 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.44 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  25.81 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  27.57 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  24.34 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  25.49 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  22.68 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.2 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2968  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  23.45 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.708756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.56 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  26.23 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  26.23 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  26.23 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.83 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.83 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.83 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.83 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.8 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>