More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2788 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
355 aa  722    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  61.88 
 
 
346 aa  441  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.66 
 
 
341 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.26 
 
 
366 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.03 
 
 
366 aa  335  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  46.94 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  45.53 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.88 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.9 
 
 
356 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.64 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.78 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.97 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.73 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.02 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.14 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.38 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  24.92 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20.8 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.49 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.07 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.28 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.07 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.25 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.7 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  27.42 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.32 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.59 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  25.51 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.05 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.36 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  26.88 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  30.48 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3136  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.43 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.56 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  25.31 
 
 
368 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.43 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.75 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  25.31 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2715  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.78 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.315016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  27.24 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.16 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  25.31 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.62 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.56 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.34 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  25 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  25.31 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  25 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.15 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.31 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  25.31 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.2 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  25.31 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  28.4 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.63 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.7 
 
 
390 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.39 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.32 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.34 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03266  RTS beta protein  30.34 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.88 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  24.27 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.37 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8215  phosphopyruvate hydratase  26 
 
 
431 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  29.05 
 
 
368 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.84 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  30.06 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.81 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  25.85 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.67 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.34 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  25.53 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.67 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.67 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.71 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  26.21 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.48 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.97 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  23.93 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.56 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.71 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25 
 
 
376 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.46 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.74 
 
 
309 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  24.91 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.42 
 
 
375 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.31 
 
 
350 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.97 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  25.86 
 
 
315 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.11 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  25.42 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.3 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>