More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0951 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
336 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  63.61 
 
 
312 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.31 
 
 
311 aa  302  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  57.23 
 
 
317 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  56.43 
 
 
342 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.03 
 
 
318 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.15 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.07 
 
 
319 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  55.08 
 
 
320 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  60.51 
 
 
317 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  54.15 
 
 
325 aa  268  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.13 
 
 
349 aa  265  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  53.87 
 
 
320 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  53.87 
 
 
320 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  53.87 
 
 
320 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  57.76 
 
 
335 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  51.76 
 
 
318 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  54.02 
 
 
326 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.57 
 
 
333 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.17 
 
 
318 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  51.44 
 
 
346 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.73 
 
 
326 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  49.38 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.5 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.94 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.47 
 
 
334 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  47.71 
 
 
357 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  35.56 
 
 
258 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.82 
 
 
353 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.31 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.79 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.79 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.79 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.79 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.79 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.82 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.26 
 
 
350 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.26 
 
 
350 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.28 
 
 
350 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.77 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.29 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.81 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.81 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  31.25 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.74 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.43 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.15 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.94 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  31.39 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.96 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.96 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.68 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.72 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36 
 
 
360 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.85 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.6 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.33 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  33.82 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.89 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  33.82 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  30.16 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.37 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.37 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.41 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.35 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  31.25 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.21 
 
 
366 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.85 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.37 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.85 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  31.25 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.37 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  30.36 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4593  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.85 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3770  muconate and chloromuconate cycloisomerases  32.85 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345801  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.38 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2328  muconate cycloisomerase  32.85 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.48 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.45 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.15 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.52 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.45 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.37 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.44 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.48 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.84 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  29.41 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.84 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3753  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.37 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>