More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0393 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
342 aa  655    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.29 
 
 
359 aa  271  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.42 
 
 
363 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.79 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.79 
 
 
369 aa  268  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.45 
 
 
369 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.67 
 
 
369 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28 
 
 
369 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28 
 
 
369 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.14 
 
 
369 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.25 
 
 
369 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.14 
 
 
369 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.25 
 
 
369 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.25 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.86 
 
 
369 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.44 
 
 
356 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.06 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.75 
 
 
318 aa  113  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.71 
 
 
368 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3571  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.71 
 
 
344 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314823  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 
346 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.34 
 
 
382 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.24 
 
 
318 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.1 
 
 
368 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.93 
 
 
349 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 
365 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.61 
 
 
359 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  31.04 
 
 
372 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.38 
 
 
388 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  39.92 
 
 
317 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31 
 
 
363 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 
365 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.33 
 
 
345 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.15 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.06 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.82 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  32.29 
 
 
366 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.29 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.03 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  23.82 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.19 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  32.12 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.73 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.57 
 
 
368 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  39.91 
 
 
335 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.72 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0799  mandelate racemase  28.27 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.6 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.03 
 
 
309 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.21 
 
 
345 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  30.95 
 
 
370 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.1 
 
 
379 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.58 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.15 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.7 
 
 
381 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.04 
 
 
393 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 
377 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.5 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.25 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  31.23 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 
370 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.48 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.45 
 
 
350 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  26.67 
 
 
370 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.78 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0941  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.19 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748604  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  32.17 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.39 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1497  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  42.54 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.35 
 
 
336 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.28 
 
 
353 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.15 
 
 
357 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.82 
 
 
381 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 
367 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3136  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
367 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.14 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.68 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  26.74 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.8 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.49 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  26.57 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.36 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.74 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.89 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.05 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.96 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.32 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  27.35 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3258  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.915646  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.68 
 
 
367 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.61 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  28.25 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.72 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.44 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  25.91 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  39.43 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>