252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2078 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 365 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.79 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.03 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.75 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  45.08 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  44.89 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  44.13 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.17 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  31.43 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  32.1 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.9 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.83 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  31.25 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  29.64 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  28.87 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  31.04 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  30.77 
 
 		 323 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  30.03 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  30.45 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  30.52 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  28.27 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  29.36 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  33.44 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  31.48 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  31.48 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  31.17 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.44 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  27.51 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  28.99 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  29.33 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.88 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.61 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  30.51 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  32.72 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  32.72 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  32.72 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  32.72 
 
 		 320 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  31.48 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.48 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  31.48 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  31.48 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  28.32 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  31.48 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  31.48 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  28.61 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  30.98 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  31.17 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  31.17 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  31.17 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.25 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  29.05 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  28.32 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  31.29 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  28.02 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.73 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.33 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.34 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.9 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  28.03 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  28.03 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  32.42 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  27.99 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.62 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  26.09 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.1 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  30.21 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.42 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  32.66 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.04 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  25.83 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.4 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  24.26 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.05 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.85 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.16 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.07 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.12 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.24 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.73 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.04 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.04 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.91 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.04 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.73 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.04 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.04 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.73 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.04 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  29.95 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.15 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.12 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  25.14 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  23.19 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  25.34 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.09 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  23.66 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  30.05 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  23.01 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>