280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11263 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  100 
 
 
346 aa  705    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.88 
 
 
355 aa  441  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.21 
 
 
341 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.01 
 
 
366 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  46.59 
 
 
356 aa  329  3e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.18 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  45.94 
 
 
360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.82 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.95 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.82 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.3 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.07 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.58 
 
 
365 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.82 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  23.14 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.47 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.71 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20.57 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.7 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.53 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  25 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.97 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.86 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.25 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.19 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  26.97 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  28 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.25 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.69 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  26.25 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  26.25 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  25.56 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  25.61 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  23.78 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  25.61 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  26.25 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  29.59 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  26.25 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  26.25 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  26.25 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  26.25 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  25.4 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.55 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  23.48 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.61 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.88 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.13 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.66 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.31 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.16 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.73 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.32 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  22.61 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.7 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3136  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.06 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207627 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.94 
 
 
336 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.26 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  22.08 
 
 
352 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3571  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.81 
 
 
344 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314823  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.29 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.97 
 
 
371 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.67 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.19 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.94 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  24.9 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  30.77 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.97 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.13 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.48 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.77 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  22.36 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0799  mandelate racemase  27 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.11 
 
 
370 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.63 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.04 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.04 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  22.08 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  25.35 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.58 
 
 
375 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
365 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  25.47 
 
 
370 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  23.4 
 
 
364 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.5 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  21.59 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.06 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  29.57 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.42 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.04 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  22.19 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  26.82 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.5 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.22 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.63 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.39 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>