169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4575 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 374 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  82.35 
 
 		 349 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  81.82 
 
 		 349 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  81.55 
 
 		 349 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  70.24 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  70.24 
 
 		 366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  69.52 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  69.25 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  68.29 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  57.34 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  55.41 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  56.01 
 
 		 351 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  54.52 
 
 		 351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  52.03 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  46.51 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  35.59 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  35.29 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.29 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  35.29 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  35.29 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  34.71 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  35 
 
 		 320 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  35 
 
 		 320 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  31.62 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  31.62 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  31.62 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  31.62 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  29.69 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  31.92 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  32.84 
 
 		 322 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  31.64 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  31.77 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  31.01 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  31.56 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  30.68 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  31.62 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  32.37 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  30.09 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  37.19 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  31.27 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  32.39 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.12 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.01 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.23 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.63 
 
 		 337 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.04 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.2 
 
 		 363 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.61 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.15 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.08 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.39 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.5 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.71 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  25.35 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  34.15 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  32.88 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  24.01 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.02 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.82 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.02 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.02 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.24 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.21 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.03 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.03 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.58 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.85 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  27.45 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.53 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  28.09 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.7 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.7 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.29 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  30.57 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  30.14 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  30.14 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  30.14 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.02 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.87 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  30.27 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.05 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.05 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2168  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.54 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.42 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  29.44 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.87 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.73 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  32.52 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.07 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.06 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.63 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4609  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.65 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>