More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2020 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
366 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.38 
 
 
366 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.26 
 
 
355 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  49.01 
 
 
346 aa  340  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  48.15 
 
 
356 aa  330  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  47.25 
 
 
360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.56 
 
 
341 aa  323  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.4 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.35 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  26.61 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.88 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.21 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.44 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.52 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.92 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.84 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.99 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.28 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.45 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.28 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.04 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.61 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.76 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.69 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.97 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.21 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.68 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.73 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  23.68 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.37 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.32 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.3 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  26.55 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.67 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  25.16 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.9 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.27 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.27 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.1 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  27.63 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  26.09 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.03 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.85 
 
 
357 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  24.41 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  25.9 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.17 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.46 
 
 
343 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  22.98 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.37 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
318 aa  63.5  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  24.3 
 
 
315 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.44 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  27.45 
 
 
322 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  24.32 
 
 
324 aa  62.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.66 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.1 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.14 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.27 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  24.91 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  25.52 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.31 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.29 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.87 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.88 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.75 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  24.7 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  31.94 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  26.67 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.75 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  24.31 
 
 
400 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.91 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.26 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.2 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.23 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.77 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.77 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.3 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.98 
 
 
353 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 
342 aa  59.3  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.29 
 
 
345 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  26.38 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  24.86 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  24.26 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.41 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.3 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.26 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.05 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3136  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.61 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0787  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.69 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  23.34 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  23.34 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  23.34 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  26.45 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.75 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.76 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  30.36 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  23.34 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  26.71 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  30.36 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>