144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0918 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
315 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  54.02 
 
 
305 aa  325  9e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  50.16 
 
 
322 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  50.16 
 
 
322 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  51.91 
 
 
320 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.48 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  48.56 
 
 
314 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  38.01 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.05 
 
 
363 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.41 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  30.74 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  30.48 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  30.21 
 
 
322 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  30.77 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  29.3 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  25.68 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.59 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  24.39 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.6 
 
 
366 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  24.31 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  24.39 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.84 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.27 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.09 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.04 
 
 
356 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.3 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.89 
 
 
368 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.73 
 
 
371 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  27.8 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  23.63 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.67 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  23.29 
 
 
368 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.67 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  23.29 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.42 
 
 
357 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  23.13 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  23.29 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  23.29 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  25.17 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  24.69 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  27.44 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.68 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  23.29 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  23.29 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.21 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.6 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  27.44 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  27.44 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  23.81 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  25.95 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  22.56 
 
 
368 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.83 
 
 
368 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  24.47 
 
 
364 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.86 
 
 
355 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.4 
 
 
368 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20.89 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  25.46 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.59 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.9 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.42 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.05 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.13 
 
 
355 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.47 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.11 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.18 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  27.68 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  27.84 
 
 
323 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  26.43 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  26.43 
 
 
323 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.04 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  25.52 
 
 
346 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.6 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  28.16 
 
 
323 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  27.66 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.82 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.01 
 
 
370 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  24.08 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  27.11 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  26.07 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.31 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  23.73 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  24.49 
 
 
372 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.83 
 
 
390 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.4 
 
 
382 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.26 
 
 
369 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  29.59 
 
 
360 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  23.81 
 
 
370 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.26 
 
 
375 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.29 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.11 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  23.38 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.49 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  24.37 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.86 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.68 
 
 
370 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.75 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.64 
 
 
370 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>