101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2437 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
322 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  61.61 
 
 
323 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  51.24 
 
 
322 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  58.7 
 
 
322 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  41.18 
 
 
323 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  40.87 
 
 
323 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  35.31 
 
 
321 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  35 
 
 
321 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  34.59 
 
 
321 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  35.62 
 
 
321 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  30.56 
 
 
315 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  31.97 
 
 
320 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.79 
 
 
309 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  30.14 
 
 
314 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  29.11 
 
 
322 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  29.11 
 
 
322 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  29.31 
 
 
305 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.75 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  34.44 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.02 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.65 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  30.72 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.12 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  28.77 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.69 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.26 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3384  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.36 
 
 
387 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3030  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.61 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.03 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1172  hypothetical protein  38.68 
 
 
379 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  35.58 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.76 
 
 
367 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.74 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.81 
 
 
365 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.2 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.2 
 
 
353 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.92 
 
 
350 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2700  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.02 
 
 
396 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.26 
 
 
342 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.2 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.96 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.96 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.69 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.85 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  31.88 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.18 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.35 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.4 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.4 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.85 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.85 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.96 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.77 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.77 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.74 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.27 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.96 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4539  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.35 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3481  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.73 
 
 
387 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24 
 
 
350 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.78 
 
 
387 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.96 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.96 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.96 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.71 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  28.69 
 
 
344 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.92 
 
 
393 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  37.14 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  31.82 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.69 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.1 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  28.52 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  36.73 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.33 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  25.68 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.57 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.21 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  34.78 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.69 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0710  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.93 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3686  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.34 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  28.14 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.41 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0365  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.05 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  34.84 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  28.14 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  26.91 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.6 
 
 
370 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.1 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  32.68 
 
 
366 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  27.76 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  28.14 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.33 
 
 
366 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.2 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.98 
 
 
390 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2153  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.7 
 
 
385 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.71 
 
 
319 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>