109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1020 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  41.98 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  38.6 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  38.6 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  38.32 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  38.71 
 
 		 305 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  39.25 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.87 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.23 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  33.55 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  30.06 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  31.8 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.78 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  27.78 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  32.49 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  31.52 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  31.77 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  31.41 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  31.16 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.25 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.39 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  30.43 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.14 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  29.82 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  31.05 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.81 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  23.37 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  25.08 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  23.71 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  28.41 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.72 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  28.41 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  28.41 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.5 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  26.74 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.85 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  28.04 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.94 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  28.04 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  28.04 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  28.04 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  27.24 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  27.24 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  32 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  31.46 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  27.24 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  27.24 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  30.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  27.68 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.05 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  26.92 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  29.51 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.56 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  27.94 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  27.94 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  27.94 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.56 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  29.55 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.75 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  25.88 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.75 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.75 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  26.64 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  25.55 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.67 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.07 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.12 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.52 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.92 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  28.69 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  30.92 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  29.14 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.04 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.04 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  25.69 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  31.58 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.05 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.21 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.08 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.49 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  31.73 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.21 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  28.39 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.19 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.21 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.74 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  28.38 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.29 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.04 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  25.32 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.56 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.12 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>