More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3153 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
352 aa  675    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  84.62 
 
 
333 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  58.36 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  58.04 
 
 
320 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  58.04 
 
 
320 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.62 
 
 
355 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  53.24 
 
 
357 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.27 
 
 
326 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  60.06 
 
 
357 aa  288  8e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  55.73 
 
 
318 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  54.55 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  53.54 
 
 
326 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.67 
 
 
334 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.94 
 
 
336 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.37 
 
 
318 aa  256  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.12 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.24 
 
 
327 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.45 
 
 
311 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  52.98 
 
 
317 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  50.46 
 
 
342 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  53.7 
 
 
312 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  53.33 
 
 
317 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  53.55 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  50.98 
 
 
325 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  51.24 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.4 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.32 
 
 
356 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.86 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.37 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.37 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.37 
 
 
350 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.32 
 
 
350 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.39 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.04 
 
 
386 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.84 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.88 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.54 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.9 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.9 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.5 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.95 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  37 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.73 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  31.98 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.33 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.44 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.16 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.27 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.38 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.39 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  30.08 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  31.86 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.09 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.34 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  31.11 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.04 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.63 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  36.97 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.91 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.89 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  29.32 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.28 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.94 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  34.76 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  34.03 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  33.52 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  33.15 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  27.84 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  30.41 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.12 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.12 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.27 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.64 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.53 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.12 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.12 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.5 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.5 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1488  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.28 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.59 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.87 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.61 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.59 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.87 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.74 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.62 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.57 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.5 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.5 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.69 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.5 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.37 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.99 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.97 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.55 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.57 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.78 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.29 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>