30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2978 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 		 258 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3261  hypothetical protein  79.46 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  37.58 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.56 
 
 		 336 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  37.54 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  39.19 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.39 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  37.81 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  35.86 
 
 		 317 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.72 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.81 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  32.01 
 
 		 318 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.71 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  38.16 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  31.25 
 
 		 320 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  31.25 
 
 		 320 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  31.25 
 
 		 320 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  31.62 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  31.73 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.73 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.58 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.12 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.11 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.94 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.38 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  44.44 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.31 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.38 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  39.86 
 
 		 357 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  28.57 
 
 		 370 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>