More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
342 aa  673    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  70.42 
 
 
312 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  61.01 
 
 
320 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  60.13 
 
 
317 aa  315  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  66.55 
 
 
317 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.07 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.43 
 
 
336 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.83 
 
 
311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.02 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.31 
 
 
318 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  54.63 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  56.65 
 
 
335 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.78 
 
 
349 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.81 
 
 
318 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.81 
 
 
333 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  51.82 
 
 
318 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  51.1 
 
 
346 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.66 
 
 
355 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  51.71 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  50.31 
 
 
326 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  51.71 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  51.71 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.46 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  48.97 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.37 
 
 
326 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.66 
 
 
334 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  50.66 
 
 
357 aa  199  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  37.58 
 
 
258 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.89 
 
 
350 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.36 
 
 
350 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.16 
 
 
350 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.16 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.56 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.34 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.91 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.12 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.12 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.71 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.99 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.92 
 
 
366 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
347 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  32.35 
 
 
370 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.64 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.79 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.65 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  32.34 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3261  hypothetical protein  46.75 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.12 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  31.25 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  36.9 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.73 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.92 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.91 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  33.67 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.16 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.91 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.07 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  31.14 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.14 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.47 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.91 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.9 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.91 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.35 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  29.55 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.29 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.7 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.3 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  32.65 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.3 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.29 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.7 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.9 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.9 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.67 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.57 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.7 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.09 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.23 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  28.51 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1083  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.57 
 
 
419 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00426043  hitchhiker  0.00242262 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.1 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  26.89 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.95 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  25.16 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.03 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.45 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.63 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.34 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.84 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.03 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  32.41 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.37 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.72 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.51 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  32.24 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  25.9 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>