294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5268 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
318 aa  617  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  84.49 
 
 
346 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  77.71 
 
 
320 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  77.39 
 
 
320 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  77.39 
 
 
320 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  72.61 
 
 
326 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.73 
 
 
333 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.1 
 
 
334 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.32 
 
 
326 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.73 
 
 
352 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.94 
 
 
355 aa  261  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.76 
 
 
336 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.19 
 
 
318 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  51.82 
 
 
342 aa  245  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  47.13 
 
 
357 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.66 
 
 
327 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.15 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  52.88 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  52.19 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  53.44 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  46.95 
 
 
325 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.69 
 
 
349 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.28 
 
 
311 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  53.17 
 
 
317 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  47.12 
 
 
317 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  50.62 
 
 
357 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.39 
 
 
318 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.73 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.4 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.76 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.36 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.36 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.4 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  30 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  36 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.94 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.17 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.17 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.17 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.42 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.34 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.97 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0941  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.77 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748604  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.98 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.98 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.76 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  27.57 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.82 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  26.92 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  26.94 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  29.24 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.11 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  33.15 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  27.94 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.96 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  28.09 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  26.57 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.35 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.42 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.34 
 
 
341 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.91 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.44 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.1 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  35.33 
 
 
372 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
433 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  35.33 
 
 
374 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  34.78 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  28.98 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  27.46 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  25.82 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.57 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  27.67 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6284  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 
424 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.67 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.05 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  26.57 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 
369 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.78 
 
 
367 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.5 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  25 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.58 
 
 
369 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.58 
 
 
369 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  36.43 
 
 
380 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.98 
 
 
342 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.58 
 
 
369 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.33 
 
 
373 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.08 
 
 
373 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 
369 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 
369 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.94 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  26.94 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>