More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0744 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
320 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
320 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  99.69 
 
 
320 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  77.39 
 
 
318 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  77.53 
 
 
346 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  77.53 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.64 
 
 
333 aa  311  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.7 
 
 
334 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.86 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.04 
 
 
352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.19 
 
 
336 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.01 
 
 
355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.48 
 
 
318 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  49.7 
 
 
357 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  55.23 
 
 
312 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.79 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  53.1 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  51.71 
 
 
342 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  52.3 
 
 
335 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  52.24 
 
 
320 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  49.35 
 
 
317 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  48.7 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.67 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.99 
 
 
311 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.7 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  51.99 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.8 
 
 
318 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.05 
 
 
350 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.05 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.05 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.53 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.05 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.14 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.34 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.47 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.47 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  35.84 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.17 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.63 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.75 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.98 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  30.62 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.43 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.17 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0941  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.77 
 
 
389 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748604  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.12 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.42 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.98 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.88 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.05 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.97 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.62 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.25 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  31.9 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  29.71 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.13 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.63 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.12 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.69 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.63 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  30.14 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.88 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.01 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.8 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.01 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.01 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.01 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  27.36 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.76 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.1 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.63 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.63 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  27.75 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.18 
 
 
378 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28.18 
 
 
387 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  32.93 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  32.93 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  25.81 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.19 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  30.25 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.52 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.78 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.98 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.48 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  28.93 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.92 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  28.9 
 
 
357 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.93 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.64 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  24.91 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 
433 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>