More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0643 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
355 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.3 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.55 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  56.8 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  56.8 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  56.8 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  56.97 
 
 
346 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.04 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  55.79 
 
 
318 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.38 
 
 
327 aa  292  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  56.16 
 
 
326 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  62.14 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  53.52 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  58.68 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.29 
 
 
336 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  59.58 
 
 
357 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  54.49 
 
 
342 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.38 
 
 
326 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.33 
 
 
334 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.66 
 
 
311 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.77 
 
 
349 aa  262  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  57.51 
 
 
312 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  54.15 
 
 
320 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.96 
 
 
318 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  55.1 
 
 
317 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  55.75 
 
 
335 aa  242  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.63 
 
 
318 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.11 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.09 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  32.14 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.44 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.63 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  31.19 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  32.94 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.18 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.87 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.63 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.11 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.17 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1174  muconate and chloromuconate cycloisomerases  33.94 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676912  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.76 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.05 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.28 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.14 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.48 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.28 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.89 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.54 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.93 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.22 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.88 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.54 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.54 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.76 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.54 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  28.27 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.54 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.54 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.94 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.24 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  34.43 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.94 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1488  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.75 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  31.31 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.36 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.94 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.27 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.88 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  33.73 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.35 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.27 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.65 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.86 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.43 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.77 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.27 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.51 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  27.68 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  29.83 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.27 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  33.93 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  34.13 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  28.88 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.7 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  34.27 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  27.54 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  34.59 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  33.45 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  26.44 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.76 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  34.3 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>