More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  100 
 
 
325 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  59.22 
 
 
320 aa  318  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.05 
 
 
318 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  60 
 
 
317 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.15 
 
 
336 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.09 
 
 
311 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  54.63 
 
 
342 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.22 
 
 
318 aa  298  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  58.22 
 
 
312 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.55 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  58.25 
 
 
335 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.31 
 
 
349 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  56.14 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.45 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.36 
 
 
355 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  48.7 
 
 
320 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  48.38 
 
 
320 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  48.38 
 
 
320 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.33 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  46.62 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  47.3 
 
 
326 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  49.12 
 
 
346 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.48 
 
 
352 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  48.81 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.26 
 
 
334 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.35 
 
 
326 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  50 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.71 
 
 
356 aa  106  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.77 
 
 
350 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.2 
 
 
350 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.74 
 
 
350 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.74 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.74 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.2 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.26 
 
 
353 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.72 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.72 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.94 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.26 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.19 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.15 
 
 
369 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.96 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.54 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.72 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.72 
 
 
369 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.72 
 
 
369 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.72 
 
 
369 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.32 
 
 
369 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  33.47 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.93 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  32.43 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.93 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.11 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.19 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.65 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.26 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  30.51 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.71 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.01 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  30.36 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.02 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.32 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.94 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.76 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.91 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.68 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  38.22 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  30.85 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.85 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.07 
 
 
373 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.74 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  31.99 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  35.29 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.04 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  32.67 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  34.13 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  30.43 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.19 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.29 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  34.92 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.55 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  26.71 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  31.63 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  31.61 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2539  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.02 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.39 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  26.79 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  29.45 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  31.08 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.11 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.33 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.16 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.95 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  32.45 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.09 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.89 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.43 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>