287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0720 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
326 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  55.86 
 
 
320 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  55.86 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  55.86 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.1 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  57.14 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  54.32 
 
 
318 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.27 
 
 
352 aa  292  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  54.18 
 
 
326 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.36 
 
 
334 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.73 
 
 
336 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56 
 
 
355 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  48.36 
 
 
357 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  54.36 
 
 
317 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.85 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.79 
 
 
319 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.84 
 
 
327 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  47.37 
 
 
342 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  54.24 
 
 
320 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.86 
 
 
311 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.84 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  44.44 
 
 
325 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  49.16 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  50.16 
 
 
312 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  50.15 
 
 
357 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  45.45 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.45 
 
 
318 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.48 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.54 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.64 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.95 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.27 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.98 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.14 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.13 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.14 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.36 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.14 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.64 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  34.21 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.13 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.36 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.13 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.72 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.77 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.26 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.72 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  33.33 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.48 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.72 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.72 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.35 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.72 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.72 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.72 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.07 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.17 
 
 
369 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  27.45 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.13 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.58 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  28.33 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.62 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  27.45 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  32.24 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  29 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.63 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.24 
 
 
373 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  27.12 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.58 
 
 
373 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.31 
 
 
367 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.71 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  28.49 
 
 
367 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.41 
 
 
373 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  31.68 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  31.09 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.81 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.88 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  32.28 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.34 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.1 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2539  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.55 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.81 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  32.28 
 
 
374 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  32.28 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  29.09 
 
 
327 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.7 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3571  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.49 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314823  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.71 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  23.88 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2021  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.85 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.66 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.11 
 
 
372 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  27.39 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0941  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.53 
 
 
389 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748604  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  27.36 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  27.31 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>