127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1485 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 323 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  99.07 
 
 		 323 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  99.07 
 
 		 323 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  80.43 
 
 		 323 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  79.81 
 
 		 323 aa  524  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  80.37 
 
 		 327 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  75.47 
 
 		 322 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  73.6 
 
 		 322 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  67.82 
 
 		 320 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  67.51 
 
 		 320 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  67.51 
 
 		 320 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.25 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  66.56 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  67.19 
 
 		 320 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  66.25 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  66.56 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  65.93 
 
 		 320 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  67.19 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  61.08 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  58.2 
 
 		 324 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  58.72 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  54.43 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  51.68 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  35.42 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.28 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  35.4 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  33.73 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  33.73 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  32.19 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  31.93 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  34.65 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  32.63 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  31.35 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  31.64 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  34.86 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  34.98 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  34.67 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  34.37 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  34.73 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.94 
 
 		 357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.67 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.66 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.85 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.12 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.61 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.3 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.82 
 
 		 356 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.71 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.69 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.17 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  30.07 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  29.49 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  29.49 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  27.7 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  26.97 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.81 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.06 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  31.88 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  27.94 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.37 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.08 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.47 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  26.3 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  25.83 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  25.89 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  28.47 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.54 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  26.97 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.01 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  29.35 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  24.52 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  28.31 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  26.43 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.08 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  25.94 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.4 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.09 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.88 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.49 
 
 		 366 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.44 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  23.83 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  23.42 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.9 
 
 		 355 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.16 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2150  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.13 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.17 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>