134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1543 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 
323 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  97.21 
 
 
323 aa  634    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  48.61 
 
 
322 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  43.34 
 
 
322 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  43.08 
 
 
323 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  41.61 
 
 
322 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  39.38 
 
 
321 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  39.32 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  36.84 
 
 
321 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  40 
 
 
321 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  30.41 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  30.07 
 
 
320 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  29.81 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  27.39 
 
 
322 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  27.07 
 
 
322 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.29 
 
 
309 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  27.18 
 
 
314 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.35 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  25.57 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  28.09 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.07 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  25.17 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  25.72 
 
 
357 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.4 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  24.32 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  25 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.53 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  26.54 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  25.19 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  27.88 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  24.56 
 
 
320 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  24.05 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  24.56 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  24.56 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.9 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  24.56 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.9 
 
 
393 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.86 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  23.26 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  25.91 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  26.13 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.46 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  25.08 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  25.08 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.21 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.36 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  28.28 
 
 
367 aa  52.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.38 
 
 
342 aa  52.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.26 
 
 
318 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  25.08 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.36 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24 
 
 
365 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.94 
 
 
365 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  24.8 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  28.87 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  26.05 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  25.25 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.36 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.76 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.93 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.36 
 
 
350 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.93 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.36 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.36 
 
 
350 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.46 
 
 
356 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.36 
 
 
350 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.36 
 
 
350 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.36 
 
 
350 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.36 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.7 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1068  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.56 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.48 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4191  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.27 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  25.57 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.16 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.4 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.43 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.93 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.23 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.11 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.43 
 
 
333 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.93 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.93 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.93 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.93 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.04 
 
 
398 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3588  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.13 
 
 
357 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.04 
 
 
398 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.46 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>