More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2249 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
345 aa  667    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.79 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.17 
 
 
369 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.9 
 
 
359 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.28 
 
 
363 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3571  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314823  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  29.14 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.76 
 
 
365 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.67 
 
 
318 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
368 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.15 
 
 
346 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.17 
 
 
355 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.53 
 
 
365 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 
346 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.21 
 
 
341 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.31 
 
 
388 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.07 
 
 
356 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.88 
 
 
349 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.61 
 
 
357 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.73 
 
 
345 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.28 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.88 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.47 
 
 
372 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.03 
 
 
363 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.71 
 
 
369 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.21 
 
 
359 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  31.07 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  28.94 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  29.32 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.32 
 
 
356 aa  92.4  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
368 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.43 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.43 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.85 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.43 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.43 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.03 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.43 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.43 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
369 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  27.79 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3828  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.82 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.126456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  27.9 
 
 
395 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.33 
 
 
395 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.64 
 
 
376 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.4 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  30.56 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.28 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.67 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.21 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.6 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  24.85 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0435  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.04 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00387295  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  21.36 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4290  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.15 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0251584  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.87 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  29.58 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.18 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.71 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2943  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.45 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.06 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.61 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.3 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.01 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.94 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.22 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.71 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.58 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  29.39 
 
 
400 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.4 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.71 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.75 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217367  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.99 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.17 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  29.06 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06558  muconate cycloisomerase I  26.4 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  26.57 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.17 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.76 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324835  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.17 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.76 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.76 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.76 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.74 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.4 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.76 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.02 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.33 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.27 
 
 
470 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.76 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.42 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.44 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30.79 
 
 
391 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>