123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1396 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 320 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 320 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  99.06 
 
 		 320 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  99.38 
 
 		 320 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 320 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  97.81 
 
 		 320 aa  634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  99.06 
 
 		 320 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  99.06 
 
 		 320 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  88.12 
 
 		 320 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  88.75 
 
 		 320 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  87.81 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  88.12 
 
 		 320 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  88.12 
 
 		 320 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  81 
 
 		 321 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  69.69 
 
 		 327 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 323 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  66.56 
 
 		 323 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  67.5 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  66.25 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  67.19 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  65.62 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  57.5 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  56.79 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  57.1 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  55.21 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  56.97 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  35.74 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  35.42 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  34.48 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  35.29 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  33.23 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  32.19 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  32.06 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  30.63 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.61 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  36.11 
 
 		 366 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  35.8 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  35.08 
 
 		 366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  35.49 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  33.02 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  32.44 
 
 		 367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  32.41 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  33.66 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.78 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.56 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.8 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.63 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.17 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.16 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.8 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.16 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.1 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.82 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.74 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.62 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  23.19 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  26.72 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.87 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.19 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  28.78 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.92 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.46 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.08 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.31 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.21 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  23.1 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.9 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  28.36 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  21.47 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.58 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.27 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.25 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.51 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  31.14 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  31.14 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  30.82 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  25.96 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  29.06 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.14 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  26.82 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  28.46 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.93 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  28.26 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  26.26 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  27.45 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  29.22 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.48 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.63 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.87 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.69 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1823  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.14 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  29.03 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.07 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>