216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1207 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  99.38 
 
 
322 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
322 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  52.81 
 
 
320 aa  338  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  50.16 
 
 
315 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.52 
 
 
309 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  48.7 
 
 
305 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  51.76 
 
 
314 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  38.6 
 
 
316 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.54 
 
 
363 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  30.95 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  27.83 
 
 
322 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  26.52 
 
 
323 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.07 
 
 
323 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  26.86 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  27.91 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  25.49 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.65 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.02 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.03 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.41 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  25.79 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  26.98 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.38 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.67 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  29.02 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.92 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.75 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  26.28 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  28.71 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.91 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.86 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.96 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  29.08 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.21 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  29.49 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  29.49 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  29.11 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  26.91 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  27.11 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  26.91 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  26.91 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  26.91 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  26.38 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  26.91 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  29.15 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  27.08 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  27.43 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  24.49 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  28.28 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  23.36 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.09 
 
 
393 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.57 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.45 
 
 
366 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  22.14 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.21 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  23.46 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  35.16 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.95 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.84 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  28.03 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.94 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  27.34 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.58 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3620  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.74 
 
 
388 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.265369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  27.11 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  26.91 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  27.34 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  27.34 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.18 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  26.98 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.57 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.18 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.51 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.13 
 
 
377 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.72 
 
 
327 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.9 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.18 
 
 
369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.18 
 
 
369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.95 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.49 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.62 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.51 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.58 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.03 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  27.17 
 
 
320 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  25.41 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.58 
 
 
369 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3098  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.32 
 
 
388 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.619628  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.58 
 
 
369 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.81 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.58 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  26.81 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  26.81 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  27.41 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.55 
 
 
370 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.03 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>