136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1102 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 324 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  60.37 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  60.61 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  58.82 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  60.06 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  58.2 
 
 		 323 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  57.41 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  58.2 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  58.2 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  56.79 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.79 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  56.17 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  57.14 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  56.79 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  56.79 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  57.81 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  57.32 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  57.32 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  57.81 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  56.79 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  56.79 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  56.48 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  56.48 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  56.17 
 
 		 322 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  55.17 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  57.01 
 
 		 320 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  57.37 
 
 		 321 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  53.7 
 
 		 322 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  33.04 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  32.54 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  32.84 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  32.23 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  30.75 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  30.77 
 
 		 364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  33.84 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  33.81 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  33.24 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  33.03 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  31.08 
 
 		 357 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  33.53 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  33.03 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  29.69 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.53 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.9 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  30.21 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.1 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.68 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.9 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.89 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.54 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  30.6 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.1 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.39 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.41 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  26.24 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  27.92 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.17 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.06 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.85 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.32 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.07 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  25.17 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.33 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  28.03 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  28.03 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  25.93 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  26.9 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.6 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.72 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.72 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.72 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.72 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.55 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.45 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.45 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.74 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  25.46 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.88 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.12 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.12 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  26.09 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.31 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.45 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.11 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.47 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.07 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.58 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4486  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.76 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  23.1 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.45 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.12 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.75 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.28 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.51 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.301111 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>