84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3601 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 352 aa  701    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  58.74 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  59.24 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  58.94 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  58.65 
 
 		 349 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  54.94 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  55.41 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  56.13 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  54.89 
 
 		 357 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  57.06 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  57.06 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  57.6 
 
 		 366 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  56.73 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  51.79 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  48.87 
 
 		 367 aa  292  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  33.23 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  33.54 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  31.71 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  31.31 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  31.67 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  33.64 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  32.17 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  30.75 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  32.93 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.88 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  30.94 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  30.63 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  30.63 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  30.63 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.63 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  30.63 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  30.63 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  30.31 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  30.31 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  30.98 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  32.13 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  30.75 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  30.75 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  30.94 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  30.94 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.43 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.19 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  31.25 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.84 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.06 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.65 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.59 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.31 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.46 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.33 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.75 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.33 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  22.08 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.07 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.68 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  25.89 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.29 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.29 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.1 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.29 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.88 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  30.13 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.95 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  28.1 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.17 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  26.22 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.68 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  26.22 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.66 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.35 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.33 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.47 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.96 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  26.62 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.38 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  29.08 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 		 309 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.83 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>