165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4159 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  95.9 
 
 		 366 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  95.9 
 
 		 366 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 366 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  96.17 
 
 		 366 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  75.41 
 
 		 364 aa  531  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  73.12 
 
 		 349 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  73.41 
 
 		 349 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  72.83 
 
 		 349 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  69.52 
 
 		 374 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  62.32 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  59.71 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  57.6 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  58.69 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  53.55 
 
 		 364 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  47.47 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  34.12 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  35.08 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  35.8 
 
 		 320 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  35.49 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.49 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  35.49 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  35.49 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  34.77 
 
 		 323 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  34.72 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  35.49 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  35.19 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  33.72 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  35.19 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  35.19 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  35.94 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  34.26 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  34.77 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  34.88 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  34.77 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  34.88 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  34.67 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  32.52 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  35.85 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  36.56 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  35.42 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  34.77 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.78 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.95 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.61 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.47 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.5 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.74 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.9 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.84 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.19 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.4 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.55 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.55 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.26 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.26 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.05 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.26 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.05 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  27.65 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.97 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.97 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  33.77 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  31.48 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.09 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.89 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  28.81 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  31.07 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.82 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  31.07 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  25.45 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.3 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  31.07 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.25 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  27.27 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.53 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.36 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.47 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.47 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.85 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.7 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.31 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.83 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.95 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  27.09 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.81 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  31.51 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.62 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  23.04 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.41 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.62 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>