More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1410 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
317 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  81.51 
 
 
327 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  73.75 
 
 
319 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  68.61 
 
 
320 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  67.54 
 
 
311 aa  345  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  65.68 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.91 
 
 
318 aa  319  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  66.55 
 
 
342 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  64.57 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.43 
 
 
336 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.85 
 
 
349 aa  298  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  64.98 
 
 
335 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.87 
 
 
318 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  54.69 
 
 
325 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.11 
 
 
355 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.32 
 
 
333 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  53.1 
 
 
320 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  53.1 
 
 
320 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  53.1 
 
 
320 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  53.1 
 
 
346 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  53.98 
 
 
357 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.98 
 
 
352 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.36 
 
 
326 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  54.58 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  54.06 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.31 
 
 
334 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  53.15 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.33 
 
 
350 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
350 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.33 
 
 
350 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
350 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  39.19 
 
 
258 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
350 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.84 
 
 
342 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.51 
 
 
356 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.84 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.84 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.84 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.84 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 
365 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.16 
 
 
390 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.34 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.44 
 
 
363 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
366 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.97 
 
 
395 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.95 
 
 
355 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.92 
 
 
386 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.84 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.51 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  34.76 
 
 
374 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.57 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.52 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.52 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.52 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.73 
 
 
369 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  34.45 
 
 
374 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.05 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.18 
 
 
346 aa  85.9  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  34.45 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.05 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.05 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.57 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.95 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  30.52 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.38 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  35.58 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.38 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.34 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.82 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.34 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  34.36 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.88 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.38 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.34 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2911  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.74 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2716  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.89 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734376  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.93 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  32.93 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2026  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.64 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5102  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.86 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.39 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  29.86 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  30.39 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.05 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.32 
 
 
386 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.38 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.73 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  31.09 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.56 
 
 
429 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5889  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.27 
 
 
360 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3283  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.46 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.77 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.17 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.91 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2539  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  32.24 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.62 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>