138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3200 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 		 323 aa  651    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  95.05 
 
 		 323 aa  621  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  80.43 
 
 		 323 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  80.75 
 
 		 323 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  81.06 
 
 		 323 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  78.26 
 
 		 327 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  75.54 
 
 		 322 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  75.85 
 
 		 322 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  67.3 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  67.3 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  66.98 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  66.98 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  66.98 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  66.98 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  67.3 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  66.04 
 
 		 320 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  66.35 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  66.04 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  60.13 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  56.17 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  54.88 
 
 		 329 aa  358  8e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  57.62 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  51.83 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  33.23 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  33.54 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  31.15 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  33.54 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  30.09 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  32.92 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  32.11 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  32.32 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.48 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  34.13 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  31.42 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  34.26 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  33.63 
 
 		 366 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  33.94 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  30.68 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  35.05 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  30.48 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.28 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.97 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.3 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.14 
 
 		 363 aa  92.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.79 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  29.02 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  28.88 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  29.02 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.09 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.3 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.33 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.86 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  26.2 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.76 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  27.76 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.92 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  29.82 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.7 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.67 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  27.91 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  28.47 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  27.83 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.82 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.05 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.8 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.59 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  26.57 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.31 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  23.2 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  24.05 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.19 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  27.11 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.08 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.03 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.62 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  28.15 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.14 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  26.92 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3167  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  24.81 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.18 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  28.16 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  29.49 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  28.16 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.65 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.87 
 
 		 368 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4107  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.02 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.130678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.84 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>