More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2715 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2715  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
392 aa  798    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.315016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.32 
 
 
369 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.32 
 
 
369 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.32 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.32 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.32 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.29 
 
 
366 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.23 
 
 
369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.48 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.44 
 
 
369 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.81 
 
 
369 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  30.25 
 
 
368 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.11 
 
 
355 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.74 
 
 
356 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.18 
 
 
356 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2700  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 
396 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  25.62 
 
 
376 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.8 
 
 
346 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.06 
 
 
369 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  29.03 
 
 
373 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.32 
 
 
369 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 
367 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.15 
 
 
347 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.85 
 
 
350 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.93 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  29.64 
 
 
372 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.95 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  29.64 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.16 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.57 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  24.94 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.35 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.59 
 
 
353 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.58 
 
 
350 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.58 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  25.81 
 
 
356 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.58 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.58 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.58 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  29.69 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.58 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.75 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.24 
 
 
364 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28.17 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  25.94 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.44 
 
 
368 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.46 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.2 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.43 
 
 
367 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  24.43 
 
 
367 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.43 
 
 
367 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  28.31 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.81 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.38 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5499  muconate and chloromuconate cycloisomerases  28 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0140  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.02 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.93 
 
 
342 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  25.21 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.43 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.08 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.56 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0485  muconate cycloisomerase  26.85 
 
 
377 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3662  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.25 
 
 
377 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246174  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.96 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.67 
 
 
400 aa  86.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.14 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  29.12 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  26.01 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  24.94 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.12 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32220  muconate cycloisomerase I  27.63 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.81 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.54 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.98 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.75 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1929  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.08 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.74 
 
 
373 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.92 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.74 
 
 
373 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  26.54 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  26.54 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  26.82 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2710  muconate cycloisomerase  26.35 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.88 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1314  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.26 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  26.34 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.58 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  25.39 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.06 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.48 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.07 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.99 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0231  muconate cycloisomerase  26.11 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.45 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  26.11 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>